Tras la Independencia de México la importancia de Sisoguichi siguió en incremento, llegando el 21 de noviembre de 1844 en ser constituido en cabecera municipal del municipio del mismo nombre, el Municipio existió hasta el 13 de octubre de 1886 en que fue suprimido e incoporado al Municipio de Carichí.2 Perteneció a este municipio hasta el 20 de noviembre de 1911 en que fue creado el municipio de Bocoyna, en el que quedó integrado.

A partir de la década de 1940 Sisoguichi se convirtió, junto con varios otros poblados de la zona, como San Juanito, en un importante centro de explotación forestal, lo cual activó la economía del pueblo y atrajo población, tanto de otras comunidades de la sierra, como de otras regiones del estado, así mismo el desarrollo de la región comenzó, al crearse carreteras, caminos y el establecimiento del Ferrocarril Chihuahua al Pacífico, que si bien no pasa por el pueblo, si mejoró considerablemente